Lancet Oncol:肾透明蛋白癌与肥胖悖论相关的转录组特征分析

2021-10-12 19:04:46 来源:
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一.深入研究或多或少

糖尿病与肝绿色巨噬细胞肝癌 (ccRCC)的高风险减低有关,但糖尿病又矛盾地与该病变的预后改善有关,其潜在机制尚不清楚。现著者对糖尿病病患和短时间腰围病患在原发病变和病变周脂肪三组织中都的肺部转化和抗体激活三组相似性进行深入研究分析。

本文介绍了性状表格达引起的微环境的相似性有助于解释糖尿病病患的穴居优势(糖尿病反例)。

二.分析流程三.撰文讲解1.COMPARZ路由表格、TCGA-KIRC路由表格、MSK抗体放射治疗路由表格数据集利用、矫正

在COMPARZ路由表格的453名病患中都,有375名(83%)病患有着一般来说的微阵列数据集,放射治疗年前BMI测量以及无成效和总质穴居数据集进行分析(表格1)。除119名(26%)过重病患外,来自COMPARZ试验的再度路由表格都有256名(68%)病患(n=256)。

表格1.COMPARZ诊断试验路由表格的人均收入统计分析和诊断特质

TCGA-KIRC路由表格中都的332可有病患中都,评估了经肝畸形放射治疗的152可有(46%)中都晚期(即AJCC III和IV期)ccRCC病患的诊断和人均收入统计分析数据集(表格2)。在回避59名(39%)过重病患后,最后赢取的路由表格都有93名病患(n=93)。

表格2.中都晚期绿色巨噬细胞肝巨噬细胞肝癌TCGA-KIRC路由表格的人均收入学和诊断特质

从62可有MSK病变一处脂肪三组织路由表格中都进行肝脏畸形的非心肌梗死绿色巨噬细胞RCC病患中都赢取了原发性病变和病变一处脂肪样品。在这个路由表格中都,从59名病患的PNN(肝周西南方)病变一处脂肪,25名病患的PNA(远离肝周)病变一处脂肪以及55名病患的病变三组织中都波形。在回避过重病患在此之后,再度路由表格都有41名(69%)PNN结果辨识病患, PNA结果辨识为17(68%),病变结果辨识为37(67%)。从最初的203名积极旁观者的MSK抗体放射治疗深入研究人大群中都回避74名(36%)过重病患后,总穴居分析的再度路由表格都有129名(64%)积极旁观者(表格3)(n=129)。

表格3. 采用MSK抗体放射治疗的诊断试验路由表格的人均收入统计分析和诊断特质

2.糖尿病的肝绿色巨噬细胞肝癌病患一般来说短时间腰围的肝绿色巨噬细胞肝癌病患总穴居期更长

根据KM穴居分析,在三三组中都都见到糖尿病病患的总穴居期更长。在TCGA-KIRC路由表格中都,经分期扫描后,糖尿病病患的总质存活期长于短时间腰围三组;在COMPARZ路由表格中都,经IMDC高风险打分扫描后,胖病患的总质存活期也长于短时间腰围三组。在MSK抗体疗法路由表格中都,经IMDC高风险打分扫描后,BMI与比率的无显著相似性(如左图1)。

左图1.TCGA-KIRC路由表格 (A)、COMPARZ 路由表格(B)和MSK抗体放射治疗路由表格(C)的总穴居期

3.COMPARZ路由表格中都糖尿病病患有着较好的PFS

对CPMPARZ路由表格KM分析后,KM曲线辨识,COMPARZ路由表格中都糖尿病病患比短时间腰围病患有着较好的PFS。

左图S1.COMPARZ路由表格中都糖尿病病患比短时间腰围病患有着较好的PFS

4.常用一线用药放射治疗,糖尿病病患仍有着较好的OS

KM曲线辨识了在常用一线酪氨酸激酶肽(pazopanib或Sunitinib)的两个放射治疗三组中都,糖尿病病患的OS几乎较短时间腰围病患好。

左图S2.COMPARZ路由表格常用一线用药放射治疗三组的总穴居期分析

5.COMPARZ路由表格中都,糖尿病与短时间腰围的病患激活三组性状特质普遍存在显著相似性

看看上述分析,著者在三个路由表格中都表明糖尿病反例普遍存在在此之后,接下来在COMPARZ路由表格中都对糖尿病和短时间腰围病患评估了病变激活三组学相似性。后于要用了Hallmark性状集的GSEA分析,相当糖尿病病患与短时间腰围病患相互间的相似性:糖尿病病患中都辨识缺氧、TGF-β、上皮-间充质转变和肺部转化瞬时闭环显著上调,提示伤口愈合途径的抑制(左图A)。左图B是对左图A筛选的几个性状表格达闭环的Enrichment plots。

左图S4.COMPARZ路由表格中都糖尿病病患与短时间腰围病患的ccRCC病变激活三组性状特质普遍存在显著相似性

6.COMPARZ路由表格与TCGA-KIRC路由表格 中都糖尿病比短时间腰围病患的肺部转化打分高

在GESA衍生的特质性状集肺部转化打分相当中都,糖尿病病患略高于短时间腰围病患(如左图2)。

左图2.COMPARZ路由表格(A)与TCGA-KIRC路由表格 (B)中都糖尿病原发病变病患与短时间腰围病患的肺部转化的z score

7.短时间腰围与糖尿病病患病变的抗体系统大群无显著相似性

对短时间腰围(7可有)与糖尿病(16可有)病患的原发病变的主要抗体系统数量皆采用流式巨噬细胞术进行评估。左图A辨识了糖尿病病患与短时间病患相互间的抗体系统大群的总质相似性。左图B清楚辨识了糖尿病和短时间腰围病患T巨噬细胞大群的伴生高水平。见到短时间腰围与糖尿病病患病变的抗体系统大群无明显相似性,抗体系统伴生的程度与BMI无关。

左图S9.用流式巨噬细胞术分析短时间腰围与糖尿病病患病变的抗体系统大群无明显相似性

8.与短时间腰围病患来得,糖尿病病患病变周脂肪三组织黏膜减低,常常是病变西南方的病变周脂肪

在MSK的非心肌梗死ccRCC病患的年前瞻性路由表格中都,著者分割了20个最显著的丰富的IPA规范闭环,这些闭环来自于糖尿病和短时间腰围病患的PNN和PNA结果辨识的相当(左图A)。糖尿病和短时间腰围病患的PNN和PNA结果辨识相互间的抗体伴生(ssGSEA打分)相当(左图B)。

左图S5.与短时间腰围的病患来得,糖尿病病患的肝周脂肪辨识出黏膜和缺氧减低

综上,在COMPARZ试验路由表格中都,经过IMDC高风险打分调整后,见到一般来说短时间腰围病患,酪氨酸激酶肽放射治疗提高了糖尿病病患的穴居率,相当多是接受sunitinib放射治疗的病患。IMDC高风险打分模型包含的三组分间接反映宿主考量对肝乳癌系统性黏膜作用(可有如贫血,中都性粒巨噬细胞增高,和血小板增高症),这些考量可能也是抗体放射治疗结果和BMI相互间相似性机制的原因。见到糖尿病病患的病变肺部转化分数略高于短时间腰围病患,与之年前其他的深入研究结果表格明的,积极参与肺部转化,β-氧化途径等等性状的富集的物理现象相一致。因此,肺部转化的相似性可以部分解释糖尿病病患接受酪氨酸激酶肽放射治疗后的较好预后。

此深入研究为糖尿病反例发放了药理学支持。在罹患ccRCC的病患观察到糖尿病病患一般来说短时间腰围的病患病变微环境的相似性:相当多是糖尿病病患的病变的肺部转化减低,但总质黏膜无明显相似性。没人注意的是糖尿病病患的病变一处脂肪辨识减低的黏膜和缺氧状况。绿色巨噬细胞肝癌与病变周脂肪三组织微环境的复杂粒子可能有着诊断意义,没人进一步深入研究。

重构出处:

Sanchez A, Furberg H, Kuo F, Vuong L, Ged Y, Patil S, Ostrovnaya I, Petruzella S, Reising A, Patel P, Mano R, Coleman J, Russo P, Liu CH, Dannenberg AJ, Chan TA, Motzer R, Voss MH, Hakimi AA. Transcriptomic signatures related to the obesity paradox in patients with clear cell renal cell carcinoma: a cohort study.Lancet Oncol. 2020 Feb;21(2):283-293

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